Thèse Modélisation des Aléas Climatiques et Cascades de Risques dans les Filières Agricoles H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Ecole nationale vétérinaire agroalimentaire et de l'alimentation, Nantes Atlantique (ONIRIS) - Site de la Géraudière (ONIRIS ING) École doctorale : École doctorale Végétal, Animal, Aliment, Mer, Environnement Laboratoire de recherche : Sécurité des aliments et microbiologie Direction de la thèse : Nabila HADDAD ORCID 0000-0001-7944-4824 Date limite de candidature : 2026-09-25T00:00:00 Le projet ACCRA vise à étudier les cascades de risques liées aux aléas climatiques dans la filière maraîchère des Pays de la Loire, fortement exposée aux sécheresses, aux précipitations extrêmes et aux inondations. Ces événements modifient la disponibilité et la qualité de l'eau, augmentant le risque de contamination microbiologique des végétaux consommés crus, avec des conséquences sanitaires (E. coli, Salmonella, Listeria) et économiques (pertes de récoltes, coûts d'adaptation, perte de confiance des consommateurs, coût pour la collectivité lié aux maladies d'origine alimentaire). L'objectif est de caractériser, de modéliser et d'anticiper ces interactions multirisques afin d'identifier les points critiques et de développer des stratégies d'adaptation efficaces, combinant mesures techniques sur l'eau et les cultures, révision des bonnes pratiques agricoles et dispositifs de prévention. L'approche repose sur la modélisation des cascades de risques dans la filière maraîchère à l'aide de modèles existants et à développer, en s'appuyant également sur des données de propagation de la contamination microbienne (élevage, épandage, eau, sols, végétaux), des données climatiques du territoire, et des données économiques. In fine, un outil de prédiction des risques ancré dans ce territoire sera créé ; il pourra servir d'outil pour l'évaluation des mesures de maîtrise de santé publique dans la filière, et par-delà, contribuera à renforcer la résilience des filières agricoles face au changement climatique.

Le projet mobilisera une approche interdisciplinaire combinant revue bibliographique, analyses statistiques, modélisation probabiliste et systémique des cascades de risques, ainsi que l'intégration de données climatiques, microbiologiques, agronomiques et économiques. Les travaux s'appuieront sur des modèles existants, des données expérimentales produites par les partenaires, des enquêtes auprès des professionnels et des simulations de scénarios prospectifs. Les développements seront réalisés principalement sous R, éventuellement parfois en Python.

Les enjeux scientifiques du projet portent sur la compréhension des interactions complexes entre changement climatique, contamination microbiologique et fonctionnement des systèmes agricoles. Dans un contexte marqué par l'évolution des régimes de précipitations et la fréquence accrue d'événements climatiques extrêmes, il devient essentiel de mieux comprendre comment ces aléas influencent les processus de transfert et de dispersion des agents pathogènes dans les agroécosystèmes. Le projet vise ainsi à analyser les mécanismes par lesquels un événement climatique, tel qu'une pluie intense ou une période de sécheresse suivie d'une irrigation, peut favoriser la contamination des eaux, des sols agricoles et, in fine, des productions végétales destinées à la consommation humaine. Un enjeu scientifique majeur consiste également à dépasser les approches disciplinaires qui traitent séparément les dimensions climatiques, microbiologiques et économiques. L'objectif est de développer une approche intégrée permettant de caractériser et de modéliser les cascades de risques dans les systèmes agricoles, c'est-à-dire les enchaînements d'événements reliant un aléa climatique initial à des conséquences sanitaires et économiques. Le projet vise ainsi à développer un cadre de modélisation intégrant des données issues de la climatologie, de la microbiologie environnementale, de l'agronomie et de l'économie agricole afin d'identifier les points critiques de contamination dans les systèmes maraîchers. Enfin, l'exploration de scénarios d'adaptation permettra d'évaluer différentes stratégies visant à limiter les risques sanitaires tout en restant techniquement et économiquement viables pour les producteurs, contribuant ainsi au développement d'approches scientifiques pour renforcer la résilience des filières agricoles face aux changements environnementaux.

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